Acrobat XI Pro でHTMLファイルをPDFファイルに変換したいのですが、うまくいきません。
環境＞
OS：Windows7
Acrobat：XI Pro
ブラウザ：IE11
HTMLファイルは、HTML5で組まれており、CSSとJavascriptの読み込まれています。
昨年（2014）は問題なくAcrobat XI Proで開きPDF保存でできたのですが、今（2015/03）に同じことをしようとしたら、外部ファイルのロード中画面がPDF化されてしまいます。
IE11から印刷処理でPDF化すると、CSSを正常に反映しませんし、GoogleChromeでも同様でした。。。
昨年は問題なくできたので、Acrobat XI Pro がバージョンアップかなどをして、この機能が制限されてしまったのでしょうか？
Acrobatもしくは他のツールでもいいので、HTML5+Javascript+CSSのPDF変換する方法をご教授ください。
ちなみにHTMLは大量にあるので、できれば複数ファイルを一括で変換できるといいのですが。。。
よろしくお願いします。